R推荐论文ecommended articles
联系我们010 6273 3808
  • 北京市海淀区圆明园西路2号
  • guojiayumi@163.com
日期推荐人文章评论 文章链接
2019/07/22 代明球,韩素文

农业生产本质是植物叶片对二氧化碳的光合作用产生碳水化合物,储存在异养器官中,并提供给人类。因此,提高作物光合作用水平是提高农业生产力的可行途径。玉米(Zea mays L.)是世界上的重要的粮食作物之一,玉米的过早衰老会降低产量,因此延迟衰老(持绿)会对产量和营养质量产生重要影响。尽管持绿性很重要,但关于玉米和其他谷物调控衰老相关基因的信息很少。本文作者结合关联分析和共表达网络对玉米衰老基因进行定位。通过全基因组关联分析(GWAS),鉴定了64个候选基因,其中14个有前人报道参与衰老相关过程如蛋白水解,糖转运和信号传导以及库活性。作者对正常衰老系B73和持绿系PHG35的差异表达基因构建共表达网络,和GWAS共定位了八个候选基因,包括海藻糖-6-磷酸合酶,NAC转录因子和......

全文链接
2019/07/22 杨琴

全基因组选择是指通过检测覆盖全基因组的分子标记,利用基因组水平的遗传信息对个体进行遗传评估,以期获得更高的育种值估计准确度,该方法已在许多作物中得到应用。建立高效的基因型和表型关系,进而获得对个体表型值更加准确和稳定的预测是一个值得深入探究的问题。基因组预测的准确性受训练集和预测集之间遗传相似性以及训练集的表型多样性的影响。全基因组选择在杂交种中的应用具有更大的挑战性。一方面,育种值是基于自交系估算的,而基因型值是用于杂交种预测,同时在杂交过程中还涉及到半同胞关系,个体间复杂的遗传关系给预测造成一定困难;另一方面,用于预测众多杂交种的表型鉴定需要很大工作量。因此,如何设计杂交种的基因组预测、选取有效的训练群体,对杂交种全基因组选择育种具有很大的理论和实践指导意义。 美国......

全文链接
2019/07/22 沈亚欧, 刘鹏

lncRNA是一类长度大于200bp的非编码 RNA,是许多植物生物过程中的关键调节因子。然而,lncRNAs 是否能够响应硝酸盐以及在硝酸盐调节过程中如何行使功能尚不清楚。近日,山东农业大学王勇老师研究团队在 New Phytologist 期刊在线发表了题为《The long noncoding RNA T5120 regulates nitrate response and assimilation in Arabidopsis》的研究论文,研究人员通过去核糖体及链特异性建库对(硝酸钾及氯化钾)不同处理下Col-0型拟南芥幼苗根系进行 lncRNA测序,结合qPCR经过生物信息学分析共预测得到695个lncRNA,其中480个为已知 lncRNA,215 个为新ln......

全文链接
2019/07/22 刘红军

增强子是DNA上一小段可与蛋白质结合的区域,在调控组织表达特异性和基因表达水平方面发挥着重要作用。增强子的功能独立于其相对于靶基因的位置,所以仅通过ChIP-seq(染色质免疫共沉淀技术)很难将增强子与相应的靶基因连接起来。长距离染色质互作对基因的转录调控很重要,其中许多基因与复杂的农艺性状有关。然而,植物染色质三维互作的模式仍然不清楚。ChIA-PET(配对末端标签测序分析染色质相互作用)具有在高分辨率下利用测序数据分析特定的蛋白质中心染色质互作的能力,利用 ChIA-PET,在哺乳动物中已经报道了一些关于基因和增强子之间互作的研究。目前,在植物中还没有关于ChIA-PET研究的报道。 本文中,作者以玉米自交系B73为材料,用抗 H3K4me3和 H3K27ac 组蛋......

全文链接
2019/07/22 韩洁楠

农业生产力本质是光合作用合成的碳水化合物在植物组织中积累程度,因此提高光合效率是提高生产力的重要途径。对于植物,尤其是一年生作物来说,进入生殖生长阶段标志着光合效率开始下降,例如玉米进入开花期,光合效率降低至50%。光合效率的降低是由于衰老进程的开始。研究发现玉米籽粒中碳水化合物的积累主要是在花后期,仅有一小部分来自茎秆和叶片的转移。一年生作物提前衰老导致产量降低,而衰老延缓型(即持绿型)对作物产量和营养品质有重要影响。延缓衰老或培育持绿型玉米是育种的重要策略。然而衰老是复杂及动态变化的过程,因此目前关于玉米或其他作物衰老的遗传信息有限。 近日Plant Cell 发表了《Integrated Genome-Scale Analysis Identifies Novel......

全文链接
2019/07/22 王桂凤

在后生动物和陆生植物中,表观遗传调控主要包括DNA甲基化和组蛋白修饰,它能够控制细胞特定基因的表达从而维持细胞的一致性。尽管在陆生植物中存在这类稳定的细胞,更重要的是其干细胞可以从胚后发育和再生的分化细胞中诱导形成。这暗示陆生植物存在内在表观遗传记忆从而起始一个新的基因调控网络。但是,表观修饰如何局部调控影响特定基因的表达而不影响其他基因的机制还不清楚。 日本国家生物基础研究所的Mitsuyasu Hasebe研究组报道小立碗藓STEMIN转录因子表观遗传再编程诱导形成干细胞。小立碗藓的叶片在不添加外源植物激素的离体培养基中能够直接转变为绿丝体顶端干细胞。通过筛选参与该细胞再编程的因子,发现异位诱导表达一类AP2/ERF转录因子STEMIN1能够激活原丝体特异基因RM0......

全文链接
2019/06/24 杨琴

棉子糖家族低聚糖(Raffinose family oligosaccharides, RFOs)在植物非生物胁迫中发挥着重要作用。棉子糖生物合成过程中的两种定向酶GALACTINOL SYNTHASE(GOLS)和RAFFINOSE SYNTHASE(RAFS)被证明与植物非生物胁迫密切相关,但是目前关于ZmGOLS2调节植物热胁迫响应的机制尚不清楚 近日,西北农林科技大学赵天永课题组在Plant Journal发表了题为“Maize HSFA2 and HSBP2 antagonistically modulate raffinose biosynthesis and heat tolerance in Arabidopsis”的研究论文......

全文链接
2019/06/24 王桂凤

亲和性是物种进化和形成的生物学基础,决定和平衡着地球上植物种群的多样性和稳定性。解析控制植物种间和种内不亲和性的分子机制一直是植物学研究的热点方向。玉米是典型的异花授粉作物,通常其自交和杂交均能正常结实。然而自然界中一些玉米材料不接受外来花粉而授精结实,这种现象被称为单向杂交不亲和性 (Unilateral Cross-Incompatibility, UCI)。由于UCI影响了花粉配子的传递方向,人们将控制这一现象的基因称之为Gametophyte Factor (Ga)。第一个玉米单向杂交不亲和位点(Ga1)最早由Correns于1902年发现,是单向杂交不亲和性最彻底的位点之一,并在爆裂玉米育种和生产上广为应用。随后多个控制玉米杂交不亲和的位点被陆续发现,主要包括三......

全文链接
2019/06/24 沈亚欧 刘鹏

热带小粒型玉米自交系SK的基因组组装为结构变异和作物改良提供新见解 目前已发表基因组数据的玉米材料(B73、Mo17、W22、HuangZaosi等)都来自温带,用作参考基因组,并不能全面揭示热带玉米的遗传多样性。华中农业大学严建兵老师团队使用多种测序方法及组装策略构建了一版高质量热带玉米基因组图谱,为热带玉米优势性状的研究提供了有力的参考。 该研究以一个热带小粒型玉米自交系 SK 为材料,应用 Pacbio 测序技术、Bionano Genomics 双酶切光学图谱、10×Genomics 和二代高通量测序数据,组装得到迄今为止最高质量的玉米参考基因组,大小为2.32Gb, Contig N50 达到 15.78Mb,通过 RNAseq、IS......

全文链接
2019/06/24 刘学

根系是植物体非常重要,但认识却很有限的一个系统。根系构型会随着土壤中水分和养分的变化而不断调整。植物是维持现有的根系形态还是产生新的侧根受遗传因素和环境因素的共同影响。由于根系是位于土壤中的巨大而复杂的系统,导致我们对根系形成的分子机理的认识非常有限。 本文介绍了一种新的方法能够量化和预测根系构型。作者在培养基中种植了B73,Mo17和它们的杂交种,对根系进行自动定时3D拍照,每4小时拍摄一次,共持续8天。通过软件对照片数据进行分析处理,重建根系形态并分析根系生长模式。从实验开始时的每个幼苗只有一个主根,到实验结束时的根系已经超过了100个分枝。虽然根系构型变化很大,但通过对根体积,根长和根数的分析发现,Mo17相比B73趋向于形成根数少但根长大的根系。为了进一步确定玉......

全文链接
154条记录12345678
联系我们010 6273 3808